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Moteur de recherche d'offres d'emploi INSTITUT PASTEUR

CLINICAL DATAMANAGER H/F


Détail de l'offre

Informations générales

Référence

2020-4274  

Date de début de diffusion

20/05/2020

Date de parution

20/05/2020

Description du poste

Métier

Informatique - Ingénieur technique confirmé (Informatique)

Intitulé du poste

CLINICAL DATAMANAGER H/F

Missions/Activités

Le projet Milieu Intérieur est une étude de cohorte ambitieuse visant à analyser l'impact de la génétique et de l'environnement, ainsi que leurs interactions, sur le système immunitaire. Les objectifs sont d'établir une compréhension approfondie de la variation immunitaire dans la population générale, et de déterminer le rôle de la génétique, du vieillissement, de la consommation de tabac, ou du microbiote dans la régulation des programmes immunitaires. Le big data manager traitera de grands ensembles de données biologiques (génomes humains, ARN-seq transcriptomes, microbiomes, protéomes, etc.), gérera le cycle de vie complet des données et développera des bases de données en ligne et hors ligne facilitant les demandes d'accès régulières aux données.

Dans le cadre de ce projet, vous serez en charge de :
- la gestion de multiples données “omics” générées par le Consortium Milieu Intérieur, en collaboration avec les coordonnateurs et bioinformaticiens du Consortium
- le dépôt de l'ensemble des données “omics” dans les dépôts publics
- la préparation des jeux de données répondant aux demandes approuvées d'accès aux données
- la création de grandes bases de données de résultats du Milieu Intérieur, afin de favoriser la reproductibilité et l'ouverture de la science

Nous recherchons un.e candidat.e qui aime coder, structurer, organiser des gros volumes de données type Big Data. Les connaissances en génétique ou en biologie seraient un plus.

Profil

De formation Master en bio-informatique, vous avez au minimum une expérience professionnelle de 3 ans dans un poste similaire.
Compétences :
- Maîtrise de l'anglais, niveau B2
- Maîtrise des langages de programmation (R, SQL, Python, Unix shell…), expérience en HPC (Calcul à Haute Performance) obligatoire
- Compétence dans le traitement de grands ensembles de données
- Grande capacité à travailler en équipe et à centraliser l'information (milieu très collaboratif)
- Bonne communication avec les membres de l'équipe

Type de contrat

Contrat à durée déterminée

Durée du contrat

3 ans

Temps de travail

Temps plein

Critères candidat

Niveau d'années d'expérience souhaitée

6 à 10 ans

Certification ou habilitation requise

Aucune

Localisation du poste

Localisation du poste

France, Paris

Demandeur

Poste à pourvoir le

01/06/2020