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L'Institut Pasteur, Institut de recherche Interdisciplinaire et International contribue depuis plus de 130 ans à l'histoire de la science, de la médecine et de la santé publique avec une immense renommée. Fidèle à l'esprit humaniste de son fondateur, l'Institut Pasteur défend le caractère avant-gardiste nécessaire à la conduite de recherches biomédicales de pointe.

Ingénieur de recherche en imagerie par spectrométrie de masse H/F

Poste à pourvoir à compter du

03/10/2022

Métier

Ingénieur de recherche confirmé

Temps de travail

Temps plein

Type de contrat

Contrat à durée indéterminée

Description de la mission/activités

Dans le cadre de la création d'une nouvelle plateforme technologique, l'institut Pasteur recherche un(e) ingénieur(e) de recherche en chimie analytique appliquée aux analyses d'imagerie par spectrométrie de masse dans le domaine de la métabolomique et de la lipidomique. L'activité de la plateforme portera essentiellement sur le développement d'approches métabolomiques non ciblées / ciblées (MS et MSI) qui seront utilisées pour soutenir la recherche de l'Institut.

Dans ce nouveau contexte, la personne aura comme principales missions de :
- Prendre en charge les développements et optimisations de méthodes analytiques d'imagerie par spectrométrie de masse (MSI) pour des analyses métabolomiques et lipidomiques à partir d'un timsTOF-Flex (Bruker). La personne sera également à l'interface entre la partie analytique et computationnelle pour aider le bio-informaticien à implémenter les bases de données d'imagerie et de développer des stratégies d'annotations sur la base de ces acquisitions.
- Prendre en charge la gestion de projet de demande d'analyses, réaliser les analyses et optimisations de MSI (de la préparation d'échantillons à l'interprétation) en collaboration avec les équipes de biologistes de l'Institut Pasteur et des externes.
- Participer à la stratégie de développement technologique de la plateforme (analytiques et traitement de données - annotation) au regard de l'état de l'art et du positionnement scientifique des unités de recherche de l'Institut Pasteur.
- Participer au maintien du parc analytique.
- Faire des formations et de l'enseignement au près des scientifiques de l'Institut Pasteur.
- Valoriser les travaux par la rédaction d'articles scientifiques et la participation à des conférences.
- S'insérer dans les réseaux scientifiques du domaine.

Profil du candidat

Expérience requise (a minima)

3 à 5 ans

Niveau d’études (à partir de...)

Bac + 8

Certification

Aucune

Niveau linguistique

Anglais (C1 - Maîtrise)

Compétences attendues

 - Titulaire d'un doctorat, Ph. D. en science avec a minima une expérience de 3 ans en développement de méthodes analytiques en MSI et en traitement de données appliquées à des analyses métabolomiques et lipidomiques.
Savoir-faire :
- Une expérience sur un MALDI-timsTOF serait un plus.
- Expérience de développement de méthodes d'analyses de quantifications
- Maitrise des outils informatiques constructeur de retraitement de données de MSI,
- Pratique des pipelines informatiques nécessaires à l'analyse des données de MSI et à l'interprétation.
- Des connaissances en biochimie, informatique, R et statistiques (statistiques multivariées, univariées et classification & prédiction (clustering, random forests, …)) seraient un plus
- Bon niveau en anglais (C1/C2)
- Autonomie à la conduite et au suivi de projets de R&D et capacité à contribuer simultanément à plusieurs types d'analyses.
- Qualités relationnelles, savoir travailler en équipe et interagir avec plusieurs interlocuteurs aux compétences différentes.

Les avantages de l'Institut Pasteur

• Prise en charge partielle des frais de transport
• Mutuelle d'entreprise
• Plan d'épargne entreprise
• Restauration d'entreprise sur place
• Avantages CSE (réductions, chèques vacances....)
• Télétravail possible selon la typologie de poste
• Formation continue