Référence

2024-11720  

Date de début de diffusion

18/03/2024

Date de parution

18/04/2024

Description du poste

Métier

Autres domaines Ingénierie de la recherche - Technicien supérieur de recherche

Intitulé du poste

ALTERNANCE - Technicien supérieur de recherche H/F

En français : titre du projet de recherche (si CDD scientifique)/sujet de stage/sujet d'apprentissage/objet de l'accueil)

Etude comparative de la diversité phénotypique et moléculaire entre des souches historiques de Trichosporon sp hébergées dans la Collection des Champignons (CFIP) et des souches actuelles collectées au Centre de Référence des Mycoses Invasives et Antifongiques (CNRMA).

Comparative study of the phenotypic and molecular diversity between Trichosporon spp strains hosted in the CFIP (Collection des Champignons) and strains collected at the National Reference Center Invasive Mycosis and Antifungals (NRCMA)

Missions/Activités

VOS MISSIONS:

Etude comparative de la diversité phénotypique et moléculaire entre des souches historiques de Trichosporon sp hébergées dans la Collection des Champignons (CFIP) et des souches actuelles collectées au Centre de Référence des Mycoses Invasives et Antifongiques (CNRMA).

a. Révision taxonomique des souches historiques de la collection CFIP identifiés comme Trichosporon spp. Comparaison des données microbiologiques et moléculaires à celles issues du CNRMA
b. Optimisation de l'extraction d'ADN génomique en vue de séquençage génome entier

Révision taxonomique des souches historiques de la collection CFIP identifiés comme Trichosporon spp.

Appliquer et valider les modes de préparation et d'analyse d'assurance qualité concernant :
a. Mise en culture sur des milieux adaptés, préparation d'examens microscopiques et mise en conservation

b. Détermination des vitesses et de températures de croissance sur milieux spécifiques

c. Production des profils protéiques par spectrométrie de masse MALDI-TOF (participation projet MALDIbank)

d. Détermination de la sensibilité aux antifongiques par méthode standardisé (EUCAST)

e. Extraction d'ADN génomique

f. Amplification par PCR de gènes d'intérêt en vue de séquençage multilocus

g. Analyse des séquences et recherche de similarité sur les bases de séquences disponibles

Comparer les données générées à partir des souches de la CFIP aux données disponibles au CNRMA
a. Comparaison phénotypique (morphologie, vitesse de croissance…)
b. Comparaison des spectres MALDI-TOF
c. Comparaison des profils de sensibilité aux antifongiques

Optimiser de la méthode d'extraction d'ADN génomique pour les souches de Trichosporon pour améliorer la concentration et pureté de l'ADN.
a. Comparaison des protocoles d'extraction disponibles
b. Dosages des ADN par Nanodrop et Qubit
c. Rédaction de la procédure assurance qualité

Profil

VOTRE PROFIL:

Vous préparez un M2 en alternance dans une filière Scientifique.

• Connaissances générales en microbiologie (manipulation de microorganismes en milieu stérile, pipetage,..)
• Savoir être
o Motivation
o Esprit critique
o Rigueur et fiabilité
o Sens de l'organisation
o Curiosité scientifique

Vos conditions et environnement de travail :
• Forfait mobilité douce ou remboursement de 75% des titres de transport
• Cantine d'entreprise, restaurants, cafétérias
• Salles de sports, 30 activités culturelles/artistiques/sportives sur le campus
• Engagements RSE forts, et initiatives des collaborateurs encouragées
• Environnement multiculturel (plus de 75 nationalités sur le campus)
• Univers multigénérationnel et qui favorise l'égalité des genres
• Une communauté active d'alternants qui se réunit régulièrement
• Et… un réseau d'alumni pour l'après (ainsi qu'une belle ligne sur le CV !)

Compétences acquises à l'issue de votre stage/période d'apprentissage

• Maitriser la démarche scientifique et les techniques en mycologie
• Mener un projet scientifique en mycologie pour explorer la diversité

Critères candidat

Niveau d'étude souhaité

Bac + 3

Diplôme souhaité

Bac+4

Certification ou habilitation requise

Aucune

Localisation du poste

Localisation du poste

France, Paris

Lieu

Demandeur

Poste à pourvoir le

01/09/2024