Référence

2024-11537  

Date de début de diffusion

16/02/2024

Date de parution

16/02/2024

Description du poste

Métier

Autres domaines Ingénierie de la recherche - Ingénieur de recherche

Intitulé du poste

Ingénieur de Recherche - Techniques de séquençage NGS H/F

Missions/Activités

La plateforme Biomics est une structure appartenant au Centre de Ressources et Recherche Technologiques (C2RT) de l'Institut Pasteur. Cette structure est dédiée au séquençage de nouvelle génération et propose des technologies de séquençage long-read et short-read. La mission de la plateforme Biomics est de faciliter la découverte scientifique au sein du Réseau International des Institut Pasteur (RIIP). Biomics travaille aussi pour des équipes de recherche hors du RIIP et avec le secteur privé. Biomics accepte à la fois des projets de service et de collaboration et travaille en étroite collaboration avec le Centre de Bio-informatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI) et la Direction des Systèmes d'Information (DSI) pour fournir des solutions d'analyse et de stockage de données pour les chercheurs.

Vous aurez comme différentes missions et activités :
1. Expertise dans les technologies long-reads - Oxford Nanopore (50% de temps)
- Développement de nouveaux protocoles adaptés aux besoins des collaborateurs
- Veille technologie et consulting sur les applications de la technologie Nanopore
- Co-organisation et animation du groupe de travail Nanopore de l'Institut Pasteur
- Gestion du compte Twitter de Biomics @BiomicsPasteur
- Gestion de l'utilisation en autonomie des séquenceurs Nanopore

2. Réalisation de projets de plateforme dans le cadre de prestations Biomics (30% de temps)
- Prise en charge de projets de la plateforme (Gestionnaire et/ou intervenant wet-lab)
- Préparation de librairie, Séquençage et Contrôle qualité des données
- Management de projets (assurer la conception et la bonne exécution des expériences de séquençage, le respect des délais, transfert de données au labo dry pour analyse)

3. Recherche et développement (20% de temps)
- Préparation de banques d'échantillons et séquençage adaptés à la demande et aux besoins des collaborateurs
- Identifier et proposer des développements innovants et d'intérêt pour les collaborateurs
- Assurer une veille technologique et scientifique
- Communications écrites (rapports de projet, publications scientifiques) et orales (réunions d'avancement, congrès, conférences…), en français et en anglais.

Profil

De formation master II ou PhD dans un domaine en santé, vous avez a minima 2 ans d'expérience professionnelle au sein d'une plateforme technologique de séquençage (NGS).
Savoir-faire :
- très bonne connaissance des méthodologies de biologie moléculaire,
- expertise des techniques de séquençage NGS,
- expertise des techniques de séquençage de 3ème génération « long-reads »
- connaissance en analyse de donnée NGS au niveau « utilisateur » via l'utilisation de : Linux, High-Performance Cluster, notions de python/snakemake (bioanalyse)
- compétences rédactionnelles pour l'écriture de documents techniques et scientifiques
- maitrise du pack Microsoft Office
- anglais courant (C1).

Aptitudes personnelles :
- bonne communication, aisance relationnelle
- travail en équipe, esprit d'équipe
- curiosité intellectuelle, goût pour la technologie et l'innovation
- compétences organisationnelles
- ouverture d'esprit
- rigueur, implication, organisation et adaptation
- proactivité, force de proposition
- management de projets

Vos conditions et environnement de travail :
- Politique de congés et RTT très favorable (Forfait 204 jours)
- Forfait mobilité douce ou remboursement de 75% des titres de transport
- Possibilité de télétravail
- Cantine d'entreprise, restaurants, cafétérias
- Mutuelle et service de santé pour les collaborateurs
- Salles de sports, 30 activités culturelles/artistiques/sportives
- Engagements RSE forts, et initiatives des collaborateurs encouragées
- Environnement multiculturel (plus de 75 nationalités).

Type de contrat

Contrat à durée indéterminée

Temps de travail

Temps plein

Critères candidat

Niveau d'années d'expérience souhaitée

0 à 2 ans

Niveau d'étude souhaité

Bac + 5

Diplôme souhaité

Bac+5

Certification ou habilitation requise

Aucune

Compétences linguistiques

Anglais (B2 - Opérationnel)

Localisation du poste

Localisation du poste

France, Paris

Demandeur

Poste à pourvoir le

08/04/2024