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Moteur de recherche d'offres d'emploi INSTITUT PASTEUR

Ingénieur de recherche- Automatisation d'expériences et biologie de synthèse H/F


Détail de l'offre

Informations générales

Référence

2021-6636  

Date de début de diffusion

13/09/2021

Date de parution

13/09/2021

Description du poste

Métier

Bio info / biostat - Ingénieur de recherche confirmé (Bio info / biostat)

Intitulé du poste

Ingénieur de recherche- Automatisation d'expériences et biologie de synthèse H/F

Missions/Activités

Le groupe InBio est une équipe de recherche interdisciplinaire en biologie des systèmes et de synthèse, combinant des approches expérimentales et computationnelles et avec un fort intérêt pour les approches quantitatives. Nous sommes affiliés à Inria et à l'Institut Pasteur, et hébergés sur le campus Pasteur.
Notre objectif principal est de développer des plateformes expérimentales, des méthodes mathématiques, des logiciels, et des approches quantitatives de biologie moléculaire afin de rationaliser et d'automatiser le processus de découverte biologique. À long terme, nous souhaitons développer un environnement de conception et de développement complet qui supporte les approches itératives de conception/construction/test/apprentissage (DBTL).
Récemment, nous avons développé une plateforme expérimentale qui intègre un ensemble de bioréacteurs, un robot pipeteur et un cytomètre, pour réaliser des expériences en turbidostat avec cytométrie automatisée. Nous avons également développé des outils logiciels pour faciliter le développement d'expériences de microscopie réactives. Nous avons également mis au point des systèmes de biologie de synthèse pour créer des consortiums microbiens et pour optimiser la production et la sécrétion de protéines chez la levure.

Nous offrons un poste en CDI pour un ingénieur de recherche expérimenté. Le candidat retenu aidera à développer des plateformes expérimentales automatisées permettant l'ingénierie de la levure et participera aux choix d'orientation scientifique du groupe.

Les principales missions du candidat retenu seront de développer davantage les plateformes expérimentales existantes afin de porter notre vision à long terme de DBTL, et de fournir une expertise, une assistance et des conseils aux projets en cours. Plus précisément, le travail consistera à
- développer une infrastructure logicielle et des protocoles automatisés pour faciliter le clonage modulaire et l'ingénierie des souches ("Build"),
- l'extension des capacités de nos plateformes de bioréacteurs ("Test"),
- l'élaboration et la mise en œuvre d'un cadre conceptuel et computationnel pour l'intégration des phases "Learn" et "Design" aux phases "Build" et "Test",
- fournir une expertise pour les tests quantitatifs, l'analyse des données et les travaux de modélisation,
- jouer un rôle de premier plan dans l'organisation et la gestion du laboratoire, et assurer l'accessibilité et la réutilisation du matériel biologique et des données à tout moment,
- préparer les publications à soumettre dans les journaux,
- participer à la stratégie à long terme de l'équipe, aux recrutements et aux demandes de financement.

Profil

Le candidat doit être titulaire d'un doctorat ou d'un diplôme d'ingénieur en bio-ingénierie. Les candidats ayant une expertise principale en biologie ou en ingénierie/informatique seront également pris en considération, à condition qu'ils puissent démontrer une expertise significative en programmation et en biologie moléculaire.

Type de contrat

Contrat à durée indéterminée

Temps de travail

Temps plein

Critères candidat

Niveau d'années d'expérience souhaitée

3 à 5 ans

Niveau d'étude souhaité

Bac + 8

Certification ou habilitation requise

Aucune

Localisation du poste

Localisation du poste

France, Paris

Demandeur

Poste à pourvoir le

01/10/2021