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Moteur de recherche d'offres d'emploi INSTITUT PASTEUR

Ingénieur de Recherche en Analyse d'Images pour la cryo-microscopie électronique - H/F


Détail de l'offre

Référence

2024-11483  

Date de début de diffusion

13/02/2024

Date de parution

15/03/2024

Description du poste

Métier

Autres domaines Ingénierie de la recherche - Ingénieur de recherche

Intitulé du poste

Ingénieur de Recherche en Analyse d'Images pour la cryo-microscopie électronique - H/F

Missions/Activités

Le Hub d'Analyse d'Images (IAH, https://research.pasteur.fr/en/team/image-analysis-hub/) de l'Institut Pasteur recherche un ingénieur de recherche en analyse d'images biologiques, pour contribuer au développement de techniques d'analyse et de traitement d'images pour la (cryo-) microscopie électronique (EM) et l'imagerie par microscopie optique.

L'IAH souhaite élargir le champ de ses activités et soutenir les projets de recherche de ses utilisateurs fondés sur les images issues de la microscopie électronique. La mission associée à ce poste se focalise sur :

1/ Le développement de pipelines de traitement et pre-processing d'images et d'une infrastructure de calcul pour exploiter les données générées par la cryo-microscopie électronique. Par exemple : correction CTF, débruitage, filtrage, corrélation multimodale et reconstruction tomographique.

2/ La mise en place de services en analyse d'images pour les chercheurs de l'Institut Pasteur, se focalisant sur les modalités d'imagerie impliquant des données d'images de microscopie électronique et de microscopie à fluorescence.

Pour ces tâches, l'ingénieur travaillera en étroite collaboration avec les ingénieurs seniors de l'IAH et au-delà. Il aura la possibilité de se déplacer pour acquérir une expertise spécifique, en fonction de l'avancement de la mission et des besoins du campus.

Profil

Le candidat idéal :

• est titulaire d'un diplôme d'ingénieur ou d'un master en (bio)informatique, (bio)physique, informatique ou tout autre domaine connexe, suivi d'au moins 3 ans d'expérience professionnelle en analyse de bioimages en recherche ou en soutien à l'activité de recherche,
• ou est titulaire d'un doctorat en bioinformatique, (bio)physique, informatique ou tout autre domaine connexe.

Compétences requises :

• Forte expérience en traitement d'images, visualisation de données et développement de logiciels scientifiques.
• Bonne connaissance des techniques d'analyse d'images pertinentes.
• Bonnes compétences en programmation (les plus pertinentes sont Python, Java, C/C++).
• La volonté et le goût de collaborer avec d'autres scientifiques sur leurs projets.
• Esprit d'équipe avec de bonnes compétences en communication et un sens des responsabilités.

Compétences désirées:

• Une expérience en microscopie/imagerie biologique est un plus, en particulier en microscopie électronique.
• Expérience en analyse de données cryo-EM et cryo-tomographie.

La langue de travail de l'AIH est l'anglais.

Type de contrat

Contrat à durée indéterminée

Temps de travail

Temps plein

Travail le we

Non

Astreintes

Non

Déplacements

Pas de déplacements

Critères candidat

Niveau d'années d'expérience souhaitée

3 à 5 ans

Niveau d'étude souhaité

Bac + 5

Certification ou habilitation requise

Aucune

Compétences linguistiques

Anglais (B2 - Opérationnel)

Localisation du poste

Localisation du poste

France, Paris

Lieu

75015

Demandeur

Poste à pourvoir le

09/09/2024